Durante la temporada 2001/02, el Burgos CF mantuvo la categoría en Segunda División bajo la batuta de Enrique Martín, pero la obligatoriedad de convertirse en sociedad anónima deportiva y la resistencia del presidente Quintano a realizar la conversión, llevó al equipo a descender nuevamente a la Segunda División B, camiseta retro valencia sumiendo a la ciudad en una nueva decepción. Entre el 10 y el 22 de febrero de 1938 participó en el Torneo de Fútbol de los IV Juegos Centroamericanos y del Caribe celebrados en Ciudad de Panamá, todos los partidos se escenificaron en el Estadio Olímpico Nacional. En 1948, Independiente Santa Fe se coronó como el primer campeón del Fútbol Profesional Colombiano, y dentro de la nómina tenía a varios jugadores formados en el club como los bogotanos Luis Alberto «Mono» Rubio y Rafael Valek, y el jugador nacido en Cajicá, Hernando «Tigre» Moyano. Las divisiones inferiores masculinas, se fundaron en el año 1944, después de la fundación del club el 28 de febrero de 1941; y desde sus inicios han sido muy importantes para el equipo cardenal, ya que de sus inferiores han salido grandes jugadores que han sido importantes tanto para el club, como para el Fútbol Profesional Colombiano, y la Selección Colombia.
En el año 1944, nace el club Monaguillos como las inferiores del equipo cardenal. Como había ganado el torneo y la copa de la temporada pasada, el reglamento estipula que el rival debía ser el subcampeón del torneo, San Lorenzo. 2011 A pesar del descenso de categoría, se logró uno de los mayores éxitos en la historia del club: Llegar a unas Semifinales de Copa del Rey, frente al FC Barcelona, tras vencer por 4-2 en el resultado global al Deportivo de La Coruña. En ese tiempo la Real pasó por momentos críticos, sumó hasta tres partidos consecutivos sin sumar e incluso llegó a ocupar puestos de descenso. De su fusión con el Aviación Nacional al finalizar la Guerra Civil hasta su relación con el régimen franquista. La suerte decidió que la SD Formentera se enfrentara en los dieciseisavos al Sevilla FC el 30 de noviembre de 2016 en el partido de ida (1-5), en un partido retransmitido por la televisión nacional.
↑ «España – SD Formentera – Resumen – Soccerway». ↑ «Claves de la derrota de Rafa Nadal». ↑ Diario El Mundo (ed.). Todo el mundo estaba pendiente de ese partido. Además, en julio del mismo año, el equipo sub-16 masculino disputó el torneo juvenil Gothia Cup en Suecia, después de haberse consagrado campeones del Torneo Ven y Conoce el Mundo. Los equipos de divisiones menores y las escuelas de formación del club, entrenan en diferentes sedes en la ciudad de Bogotá, y en las ciudades de Cali, Armenia, Sincelejo, y Cúcuta; además de tener sedes en los municipios de Cajicá, Funza, Chía y en el sector de Siberia en el departamento de Cundinamarca. Para 2011, el profesor Albeiro García tomó las riendas del club, sin embargo los resultados no le ayudaron para continuar con el puesto durante el segundo semestre, ya que el equipo quedó sin chances de avanzar a las finales del Torneo Postobón, además porque recibió y aceptó un ofrecimiento de Itagüí Ditaires para que fuera asistente técnico de Carlos Mario Hoyos. Por lo tanto, el lugar que los mallorquines dejaban la ocuparía el segundo clasificado: la SD Formentera. Una vez más el Formentera hacía historia y terminó aquella tanda ganando (10-9). En tercera ronda, camisetas personalizadas valencia los de Tito viajaron a Navarra para enfrentarse al Tudelano.
La ´senyera´ se mantiene hasta la temporada en Segunda (1986-87) e hibernó durante casi dos décadas, a excepción de una versión de mediados de los 90, con Francisco Roig de presidente, con una camiseta azul con franjas amarillas y rojas en el hombro. Alfonso Cañón, Ernesto Díaz, Carlos «Copetín» Aponte, Jaime Silva, Hernando «Mono» Tovar, Héctor «Zipa» González, Alonso «Cachaco» Rodríguez, James Mina Camacho, Eduardo Niño, Adolfo «Tren» Valencia, Freddy Rincón, Léider Preciado, Agustín Julio, Iván López, Francisco Meza, Camilo Vargas, Juan Daniel Roa, y Daniel Torres entre otros, han sido jugadores de las divisiones menores del club. El equipo juega en el Campo Municipal de Deportes de Can Carlos de San Francisco Javier, inaugurado el 30 de septiembre de 1973 en encuentro de liga frente al San Rafael CF. El hecho de que en la temporada anterior el Mallorca B ganara la liga le permitía jugar la Copa del Rey.
